Eleito em um momento de profunda crise após a morte de Vigílio, Pelágio I teve que trabalhar arduamente para provar sua ortodoxia e pacificar o clero italiano. Ele dedicou seu pontificado à reconstrução material e espiritual de Roma, devastada pelas guerras góticas. Usou sua fortuna pessoal para aliviar a fome e a pobreza da população. É lembrado por iniciar a construção da Basílica dos Santos Doze Apóstolos.