De família aristocrática, Sérgio II foi eleito sob aclamação popular, mas sem a confirmação imperial, o que gerou tensões com o imperador Lotário I. Seu pontificado foi marcado pelo terrível ataque sarraceno a Roma em 846, que resultou no saque das Basílicas de São Pedro e São Paulo (que ficavam fora das muralhas). Ele trabalhou na reconstrução e fortificação desses locais sagrados.