Vigílio teve um pontificado longo e extremamente polêmico. Levado a Constantinopla pelo imperador Justiniano, foi pressionado a condenar os chamados “Três Capítulos” (escritos considerados nestorianos). Sua hesitação e mudanças de posição causaram confusão no Ocidente. Ele participou sob coação das tensões que levaram ao Segundo Concílio de Constantinopla (553 d.C.). Morreu na Sicília quando finalmente tentava retornar a Roma.