Após o longo intervalo de sede vacante, São Marcelo I assumiu com a difícil tarefa de reorganizar a Igreja devastada. Ele dividiu a administração de Roma em 25 distritos para facilitar o batismo e a penitência. Ele foi muito rigoroso com aqueles que tinham renunciado à fé durante a perseguição, exigindo penitência pública antes da readmissão. Isso causou revoltas populares, e o imperador Maxêncio o baniu de Roma. Segundo a tradição, ele foi forçado a trabalhar como escravo em um estábulo antes de morrer.