O pontificado de Anastácio II foi marcado pela tentativa de reconciliação com o Oriente para acabar com o Cisma Acaciano. Sua postura mais moderada foi interpretada por alguns membros do clero romano como uma fraqueza ou traição, o que gerou tensões internas. Ele foi o Papa que celebrou a conversão de Clodoveu, rei dos Francos, um evento decisivo para o futuro do cristianismo na Europa Ocidental.